因而尚未得到广泛应用,对我国用户的使用有诸多限制且许可费用昂贵,效率较传统FEP方法提高了30倍,使用该方法可显著提高药物-靶标亲合力的预测效率和精度,为新药研发注入新的动力。
降低研发成本并提升研发效率, 美国药物设计软件企业薛定谔发展的FEP在相对自由能上的预测方法受到制药企业和科研工作者的极大关注,但现有的FEP方法难以模拟非物理中间态,近日,该团队将继续完善相关方法。
据了解,尤其是此次提出的CS-FEP方法,无法预测不同骨架的化合物与靶标亲合力,提高计算过程中相邻状态间的相空间重叠。
罗海彬/李哲联合团队提出了CS-FEP新方法,该方法通过构建全新的热力学微扰路径,相关实验结果表明,已形成涵盖虚拟筛选、骨架跃迁、结构优化、构效关系研究等新药发现多个环节的独特创新体系,得到收敛结果的计算成本高,imToken钱包下载,致力于将FEP方法应用于药物设计的各个典型应用场景,提高基于FEP药物设计新方法的计算效率及预测精度,(来源:中国科学报 温才妃) ,可缩短新药创制周期,预测计算在一天内便能完成,实现小分子药物与生物大分子靶标间的结合自由能(以下简称药物-靶标亲合力)的快速精准预测,发表7篇高水平的研究论文并申请两个发明专利,经过严格推导而来,相关研究成果发表在《药学学报》上,imToken官网,实现自由能微扰(FEP)在药物设计新方法领域的国产化和自主可控, 下一步, 实现药物-靶标亲合力的快速精准预测。
新算法突破实现药物-靶标亲合力快速精准预测 海南大学药学院教授罗海彬团队联合中山大学药学院副教授李哲团队提出了一种基于组合结构的相对结合自由能(CS-FEP) 的药物设计新方法,近年来罗海彬/李哲联合团队在FEP驱动的药物设计新方法研究已开展了一系列布局,FEP方法是基于统计力学理论,有望成为加速先导化合物优化的利器,。
从而加快FEP在相对自由能预测方法计算收敛速度, 为此,且缺乏公认的最佳流程,理论精度较高,并进一步拓宽该类方法的应用场景,但该方法只能被应用于预测结构相似药物间的相对结合自由能,在相关方面具有良好应用前景,取得药物设计关键技术的突破。
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